Constituída desde a década de 80 do século XX, integra material arqueológico diverso, proveniente de recolha e de escavações arqueológicas. Desta, destaca-se a coleção de Tabuleiros e pedras de Jogos Islâmicos, pelo seu cariz único, de declarada importância regional, e quiçá nacional, constituída por trinta e nove tabuleiros gravados em lajes de xisto, completos ou fragmentados, de seis tipologias diferentes, Moinho, Galo, Tábula, Soldado (?), Alquerque e Mancala III (?) e 18 pequenas pedras de jogo, provenientes de um único sítio arqueológico, o Castelo Velho de Alcoutim.